Третья часть ответвления франшизы под заголовком «Вознесение» и сюжетное продолжение аниме-фильма «Призрак в доспехах: Вознесение — Говорящая с призраками». Мотоко Кусанаги [草薙 素子] и Бато [バトー] пытаются остановить террористическую организацию, символ которой — это древнегреческое чудовище Сцилла. Параллельно с этим Тогуса [トグサ] расследует дело об убийстве человека, который носил протез, изготовленный корпорацией «Нога Русалки». Есть ли связь между этими происшествиями — остаётся тайной.