История начинается с угроз против губернатора Токио. Вскоре, лишь с помощью умения Конана [江戸川 コナン] быстро мыслить и предсказывать любые смертельные исходы, удаётся предотвратить взрыв в туннеле метро. Конан получает информацию, что возможна связь преступника с деревней, которая была перенесена из-за строительства дамбы. И великому детективу приходится мчаться со всех ног, чтобы остановить преступника перед тем, как он осуществит следующую атаку.