Новая Вестроя была спасена, и «Отчаянные бойцы» уже было расслабились, как вдруг появляется Рен Кролер с Гандэлии, который пытается перетянуть на сторону своей планеты «Отчаянных бойцов». Рен убеждает их в том, что ему нужна помощь, дабы защитить свою планету от нифианцев. Дэн [空操弾馬] и его друзья охотно верят ему, но в это же время появляется принцесса Фабия [ファビア・シーン] с планеты Нифия, которая рассказывает, что настоящие враги «Отчаянных бойцов» — это гандэлианцы, а нифианцы — те, кому действительно нужна помощь. Рен пытается перетянуть на свою сторону других бойцов бакуган, как бы «зомбируя» их. Итак, Дэну, Маручо [丸蔵兆治], Джейкобу [ジェイク・ヴァレリ], Шуну [風見駿] и Фабии [ファビア・シーン] предстоит остановить гандэлианцев, а также не позволить последним уничтожить Нифию и Землю.