Кайто Куроба снова посылает записку о том, что собирается совершить кражу в поезде. В этот раз его цель самый большой топаз в Европе "Мать кристаллов", который является драгоценностью империи Инграм. После того как Сэлизабет в первый раз помешала Кайто уйти с топазом она прячет его в неизвестном месте. Так же маленький принц Филипп [フィリップ], желая снова услышать похвалу от матери, старается поймать преступника. Сможет ли Кайто обхитрить королеву и заполучить желаемую драгоценность? Ведь на этом же поезде по случайному совпадению едут не только великий детектив Эдогава Конан [江戸川 コナン] и инспектор Гинзо Накаморе [中森 銀三], но и опасные преступники Змея [スネーク] и Роза [ローズ].