Это приключение начинается, когда Пазу [パズー], подмастерье инженера, знакомится с девочкой Ситой [シータ], буквально упавшей с неба к нему на руки. Сита летела на дирижабле, который подвергся атаке воздушных пиратов. Она бы разбилась, но её спасает сила висящего на шее талисмана, за которым и охотились пираты. Вскоре вдвоём они отправляются на поиски легендарного небесного замка Лапута, путь к которому открывает талисман. Однако дорога не будет простой: алчные пираты, секретные правительственные агенты и армия встанут на их пути к тайне летающего острова, последнего следа исчезнувшей древней цивилизации...