Синдзиро Хаята не просто от природы обладает особыми силами, он ещё и сын Сина [早田 進] — человека, ставшего первым в истории Ультраменом. Вот только узнаёт об этом Синдзиро только тогда, когда на него нападают неизвестные враги. От злодеев Синдзиро спасает Ультрамен, а потом снимает маску, чтобы рассказать, что на самом деле он его отец. У Синдзиро нет выбора — он надевает костюм, изготовленный бывшим членом СНПО (Специальный Научный Поисковый Отряд) господином Идэ, и решает помогать отцу. С этого момента и начинается настоящая битва.